The Cancer LncRNome Atlas



Ovarian Serous Cystadenocarcinoma (OV)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in OV

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000259865chr1247350583247351828-
ENSG00000232347chr1247373993247405125-
ENSG00000236817chr1247728941247804156-
ENSG00000235749chr1247803051247910364+
ENSG00000232694chr1248881947248885506-
ENSG00000232656chr1010686061090138+
ENSG00000237399chr1031838243210164+
ENSG00000233117chr1042777524285981-
ENSG00000205488chr1055562075568209-
ENSG00000242147chr1056369545638081-
ENSG00000226647chr1057541375786030-
ENSG00000232807chr1059790795987863-
ENSG00000213994chr1062395756244656-
ENSG00000237943chr1066223816627641+
ENSG00000259812chr1066281866628882+
ENSG00000223784chr1067793446780988+
ENSG00000238266chr1068215606884868+
ENSG00000225383chr101082640010836943-
ENSG00000225778chr101189161211936699-
ENSG00000228302chr101228675012289844-
ENSG00000233256chr101345720213465133+
ENSG00000268549chr101372452113726874+
ENSG00000232739chr101527949115283766+
ENSG00000229124chr101725623817271984-
ENSG00000234961chr101727532417276832-
ENSG00000260589chr101768328317685877-
ENSG00000240291chr101880204418834580-
ENSG00000225527chr101882077818822265-
ENSG00000152487chr101894019518948214-
ENSG00000238246chr102035973420380713-
ENSG00000231920chr102146294321463977+
ENSG00000261671chr102254671522547477+
ENSG00000272516chr102262133322621916+
ENSG00000271981chr102262151622621910-
ENSG00000224215chr102363288623634110+
ENSG00000231976chr102693209826942383+
ENSG00000232224chr102722013527230930-
ENSG00000236983chr102723225227233347-
ENSG00000262412chr102753205927539733+
ENSG00000254635chr102881158128821672-
ENSG00000224597chr102969833129776674+
ENSG00000259994chr103059175530594995-
ENSG00000237036chr103149520731609376-
ENSG00000237797chr103198201231996316-
ENSG00000227253chr103255521732558402+
ENSG00000238258chr103350020533502732+
ENSG00000223470chr103419816634206723+
ENSG00000226386chr103510469535105314+
ENSG00000230534chr103538693435415948-
ENSG00000269952chr103549934435499678+
ENSG00000271335chr103560348035625329-
ENSG00000237002chr103672754436731320+
ENSG00000226578chr103806429938073059-
ENSG00000236514chr103814666838148038+
ENSG00000185904chr104297099142990784+
ENSG00000272373chr104306963343134016-
ENSG00000259869chr104324662643247593-
ENSG00000230555chr104391618643917548+
ENSG00000226245chr104413932044140495+
ENSG00000230565chr104414139044143467+
ENSG00000229116chr104478770644789157-
ENSG00000231964chr104594001845948569-
ENSG00000272430chr104691414546917230-
ENSG00000229227chr104693746346951699-
ENSG00000231187chr104695147246966835+
ENSG00000223477chr104701175347174018-
ENSG00000254929chr104720780547243502-
ENSG00000259942chr104765608447657233+
ENSG00000235939chr105062732350680949+
ENSG00000244393chr105125314651371338-
ENSG00000178440chr105173252351741813+
ENSG00000226200chr105238891052391396+
ENSG00000228651chr105431646254515169-
ENSG00000227121chr105473324854735575-
ENSG00000227877chr106149675361513203-
ENSG00000232682chr106181563261820501+
ENSG00000254271chr106249410062501586+
ENSG00000228065chr106733020867526299+
ENSG00000234635chr107023775670240521-
ENSG00000260400chr107045825770460551+
ENSG00000231748chr107102509871027904-
ENSG00000224222chr107175438271767592-
ENSG00000237998chr107262524572626128-
ENSG00000237512chr107297698172977985-
ENSG00000236756chr107500711875036742+
ENSG00000227540chr107501254975014107+
ENSG00000233144chr107514119175143254+
ENSG00000221817chr107525528375279828+
ENSG00000268584chr107538575475386548+
ENSG00000271848chr107541379775434477+
ENSG00000242288chr107543405375490272-
ENSG00000271816chr107545890975490245-
ENSG00000272140chr107546398375473339-
ENSG00000224195chr107557327675574495+
ENSG00000225761chr107576489575787673+
ENSG00000267957chr107588001375880621-
ENSG00000269772chr107588080075881121+
ENSG00000226051chr107702957777133258+
ENSG00000270087chr107703948477161004-
ENSG00000237149chr107716075977168738+
ENSG00000228280chr107750249877503513+
ENSG00000236467chr107864780278740382+
ENSG00000228748chr107954262479552934+
ENSG00000233871chr107968713079689582+
ENSG00000230417chr108000850580434724+
ENSG00000224596chr108070308580827652-
ENSG00000244733chr108142064581437248+
ENSG00000226381chr108142284481526085-
ENSG00000225484chr108156381381586350-
ENSG00000272447chr108158565881587358+
ENSG00000230091chr108180661681838668-
ENSG00000237523chr108196746681979413+
ENSG00000271738chr108219476582196869+
ENSG00000226659chr108228935382295698-
ENSG00000271933chr108589817685900338-
ENSG00000229404chr108603973686054415+
ENSG00000227896chr108828170288282443+
ENSG00000271880chr108873049888769883+
ENSG00000237280chr108887371188875280+
ENSG00000223482chr108896363289102369-
ENSG00000224914chr108910249389117639+
ENSG00000180139chr109069242890700368+
ENSG00000261438chr109077559390776816+
ENSG00000232110chr109104352291051882+
ENSG00000232936chr109140503991410424+
ENSG00000232229chr109158926791600618+
ENSG00000228701chr109354259693558048-
ENSG00000268894chr109603903496046828-
ENSG00000234026chr109698800096990901-
ENSG00000226688chr109751296397849995-
ENSG00000177853chr109788947297965044+
ENSG00000231025chr109875220798755716+
ENSG00000225850chr109909432199102770+
ENSG00000231970chr109916087299179281+
ENSG00000230928chr10100011780100016332+
ENSG00000224934chr10101190948101195542+
ENSG00000260475chr10101380812101381675+
ENSG00000229278chr10101411746101413662-
ENSG00000227695chr10101686767101718138+
ENSG00000236308chr10101949793101950504+
ENSG00000227492chr10101989424101993757+
ENSG00000235823chr10102133372102143125+
ENSG00000236662chr10102740264102745371-
ENSG00000226009chr10103578835103588536+
ENSG00000269609chr10104209574104220863+
ENSG00000203886chr10104592478104594273+
ENSG00000234699chr10105212603105222452+
ENSG00000260461chr10105637132105639519-
ENSG00000228261chr10106083127106086762+
ENSG00000231233chr10106111349106113333-
ENSG00000232470chr10112629501112631352+
ENSG00000203497chr10112629626112631991-
ENSG00000270589chr10112670354112672002+
ENSG00000232934chr10114165977114169252-
ENSG00000260917chr10114583249114587485+
ENSG00000233547chr10114710405114711634-
ENSG00000232767chr10118429614118432250+
ENSG00000225302chr10118592512118609716-
ENSG00000229847chr10119232726119304579-
ENSG00000177640chr10119805790119969663+
ENSG00000238276chr10120001076120027222+
ENSG00000232139chr10120116620120124615+
ENSG00000227165chr10122521324122610721-
ENSG00000271670chr10122638768122640179-
ENSG00000226864chr10123687827123711480+
ENSG00000249456chr10126605712126631450+
ENSG00000224023chr10127389005127408135-
ENSG00000234134chr10127407340127407934-
ENSG00000236991chr10127433296127440679-
ENSG00000227374chr10131567108131567699+
ENSG00000237489chr10131864638131909081-
ENSG00000231705chr10134232587134234457+
ENSG00000234311chr10134247237134254988-
ENSG00000226900chr10134325130134331695-
ENSG00000229081chr10134334331134335953-
ENSG00000232903chr10134757471134778793-
ENSG00000235245chr10135108691135109481-
ENSG00000230724chr11127115139612-
ENSG00000255026chr11287305288987+
ENSG00000254910chr11310139311141-
ENSG00000251661chr11318640325631+
ENSG00000270030chr11325703326294-
ENSG00000255328chr11327171330122+
ENSG00000270972chr11333192333688+
ENSG00000255237chr11462930463899-
ENSG00000254739chr11528907529659+
ENSG00000254815chr11557595560107+
ENSG00000247095chr11565660568457-
ENSG00000255158chr11665910678391+
ENSG00000269915chr11708564727047-
ENSG00000255142chr11781645782105+
ENSG00000255108chr11823634832883-
ENSG00000250397chr11856880859795-
ENSG00000255153chr1113309991331937+
ENSG00000233930chr1115925831620414+
ENSG00000235027chr1117815781783716+
ENSG00000229512chr1117842391784979-
ENSG00000229671chr1119238771929145+
ENSG00000226416chr1120044672011150-
ENSG00000232987chr1120123262014699+
ENSG00000130600chr1120164062022700-
ENSG00000240801chr1121503512151194-
ENSG00000099869chr1121617312169894+
ENSG00000238184chr1123499792399222-
ENSG00000230483chr1124257452429138+
ENSG00000269821chr1126295582721224-
ENSG00000229414chr1128613652882798-
ENSG00000250404chr1138379823843130+
ENSG00000228661chr1138755483876739-
ENSG00000229368chr1138758423876629+
ENSG00000254480chr1142083704223885+
ENSG00000167355chr1153262065526882-
ENSG00000267940chr1162231316224483-
ENSG00000255390chr1166426826643553+
ENSG00000251364chr1174484977533746-
ENSG00000254951chr1177759407927502-
ENSG00000254665chr1187149048718154+
ENSG00000254860chr1189862228999074+
ENSG00000253973chr1190257099086701+
ENSG00000245522chr1197763179781080-
ENSG00000246273chr1197798399832866+
ENSG00000177112chr111056281910621479+
ENSG00000246308chr111083084410844478+
ENSG00000247271chr111087980610928349+
ENSG00000250041chr111090643210920869-
ENSG00000255462chr111159163111595329+
ENSG00000254680chr111228297312284720-
ENSG00000254847chr111255963012562514-
ENSG00000203258chr111294273312944472-
ENSG00000251381chr111298405713011095-
ENSG00000254670chr111302263713030706-
ENSG00000254438chr111394299713946410-
ENSG00000152268chr111398391414289646+
ENSG00000254418chr111428439214295237-
ENSG00000260196chr111740219617405078+
ENSG00000255071chr111825297018270182-
ENSG00000256006chr111842715618428278+
ENSG00000247595chr111862133418631802+
ENSG00000254966chr111872808418762115+
ENSG00000270607chr111973248019734165-
ENSG00000254453chr112006539220070849-
ENSG00000246225chr112285092622966939+
ENSG00000254560chr112706873327241660-
ENSG00000254862chr112749327627503980+
ENSG00000245573chr112752838527719721+
ENSG00000255322chr112837365428548588+
ENSG00000254532chr113006560530105890-
ENSG00000255480chr113044709930450815+
ENSG00000254489chr113060567730652055+
ENSG00000183242chr113245706432480315+
ENSG00000247151chr113318320333213144+
ENSG00000261355chr113583588235839557+
ENSG00000254907chr114335029843380846-
ENSG00000246250chr114385125943902276-
ENSG00000244926chr114393084243942494-
ENSG00000254427chr114537692245387672+
ENSG00000255091chr114567307945674241+
ENSG00000255498chr114592749245928012-
ENSG00000247675chr114686796346895947+
ENSG00000270060chr114718983247191114-
ENSG00000256897chr114724176947243302-
ENSG00000255197chr114740469947430741-
ENSG00000270072chr114753515747536441-
ENSG00000254662chr115709307757095432+
ENSG00000254602chr115740549757420263+
ENSG00000255240chr115870111658826132-
ENSG00000245571chr115889760658910488-
ENSG00000255139chr115938390259407334+
ENSG00000255355chr115943678559443514+
ENSG00000254477chr115952048859522448-
ENSG00000257052chr116067426160677214+
ENSG00000256196chr116068594160692869-
ENSG00000256443chr116130698861309731-
ENSG00000255118chr116210438362105562-
ENSG00000255126chr116215898862160844-
ENSG00000257058chr116231347162315171+
ENSG00000267811chr116253859262539078-
ENSG00000269176chr116255349862554257-
ENSG00000269463chr116257515462575535-
ENSG00000256690chr116259970662601515+
ENSG00000255717chr116261946062623386-
ENSG00000188070chr116352736463536113-
ENSG00000255651chr116353481663536113-
ENSG00000256116chr116399668664001824-
ENSG00000256940chr116401343664015689+
ENSG00000257086chr116401441164016966-
ENSG00000236935chr116409252264096976-
ENSG00000269038chr116454642664546877+
ENSG00000269290chr116455239364553092-
ENSG00000267804chr116465815864658547-
ENSG00000254501chr116487818664879167-
ENSG00000245532chr116519024565213011+
ENSG00000251562chr116526523365273940+
ENSG00000260233chr116533713165337744-
ENSG00000255557chr116551320065539056+
ENSG00000255120chr116555652265558339-
ENSG00000255320chr116601231166013710-
ENSG00000254461chr116602703866029305-
ENSG00000254855chr116603224866033137-
ENSG00000245156chr116603730366045996-
ENSG00000254510chr116617662966184608+
ENSG00000255517chr116624096166247704-
ENSG00000269990chr116630336966305407-
ENSG00000258297chr116643350766435845+
ENSG00000256514chr116711904367141055-
ENSG00000269913chr116722733967227784+
ENSG00000270169chr116722918167229791-
ENSG00000255318chr116738575067394775-
ENSG00000251637chr116765394867673821+
ENSG00000255306chr116779227767797928-
ENSG00000255031chr116781820767821229+
ENSG00000255236chr116788952067897985+
ENSG00000260808chr116838036768384179-
ENSG00000250508chr116863813268642010+
ENSG00000255741chr116870897168710320-
ENSG00000261625chr116876823368769516-
ENSG00000259799chr116892337868927220+
ENSG00000260877chr116918623169187279+
ENSG00000254605chr116986096469867165-
ENSG00000254721chr117005239770053496-
ENSG00000254604chr117012847370209474-
ENSG00000246889chr117021835270244594-
ENSG00000254682chr117115972071163203+
ENSG00000248671chr117150540971524905-
ENSG00000251143chr117172533771731956+
ENSG00000256633chr117229561672299023+
ENSG00000256007chr117239612072404853+
ENSG00000245148chr117241151972416652+
ENSG00000260401chr117295002072953380+
ENSG00000257038chr117301828073020406-
ENSG00000256928chr117310660473107481-
ENSG00000256034chr117347160873472115+
ENSG00000256360chr117363957873641417+
ENSG00000255847chr117367470273681332-
ENSG00000254837chr117420441174209578+
ENSG00000254429chr117497117174972069+
ENSG00000255326chr117529424175305710+
ENSG00000255434chr117530718975308315-
ENSG00000255507chr117551447675526451-
ENSG00000254933chr117590176975906115+
ENSG00000255362chr117592200075927069-
ENSG00000272301chr117610069276101172+
ENSG00000271757chr117610324076103949+
ENSG00000255135chr117615238276155700-
ENSG00000254810chr117636521376367756-
ENSG00000236304chr117636810076374910+
ENSG00000255100chr117649362576494106-
ENSG00000261578chr117651140876515599+
ENSG00000254459chr117754070077583308-
ENSG00000254691chr117756165077562557+
ENSG00000255449chr117757745877581137-
ENSG00000254829chr117772676177727541+
ENSG00000246174chr117785081777886369+
ENSG00000254420chr117803580478155095+
ENSG00000251323chr117813502878140882-
ENSG00000255345chr117880389378809048+
ENSG00000246067chr118278310882817761+
ENSG00000254676chr118289118682895562+
ENSG00000247137chr118289553382904836-
ENSG00000255234chr118299717183134559+
ENSG00000254731chr118641414186425134+
ENSG00000255471chr118660325686636079-
ENSG00000246523chr118666666186712001+
ENSG00000254911chr119345467993455032+
ENSG00000250519chr119397131694012372+
ENSG00000255893chr119420607494206736-
ENSG00000257057chr119424574794265289+
ENSG00000245552chr119488370394967268+
ENSG00000248027chr11100554893100558686-
ENSG00000255337chr11102323650102332739+
ENSG00000256916chr11102477647102498801+
ENSG00000110347chr11102733467102745764-
ENSG00000260966chr11102921416102926528-
ENSG00000254433chr11105956717105972702-
ENSG00000260512chr11106544738106550066-
ENSG00000261098chr11107182858107186997-
ENSG00000271390chr11110960594110961092-
ENSG00000271584chr11110962656110968081-
ENSG00000250303chr11112141472112233257+
ENSG00000254968chr11112263841112492452+
ENSG00000247416chr11112830002112834182-
ENSG00000227487chr11113140254113144623-
ENSG00000255129chr11113149159113185159-
ENSG00000270179chr11113239200113239839+
ENSG00000256603chr11113641115113642413-
ENSG00000255689chr11115453015115471057+
ENSG00000246100chr11115624966115631345-
ENSG00000226645chr11116644105116644921+
ENSG00000231611chr11116645826116646592-
ENSG00000235910chr11116706833116726445+
ENSG00000250699chr11117187078117198754-
ENSG00000254528chr11117704434117709657+
ENSG00000255435chr11118382626118401809-
ENSG00000255176chr11118507338118508815+
ENSG00000255422chr11118575316118620973+
ENSG00000255121chr11118865534118868714-
ENSG00000254428chr11118874452118875603-
ENSG00000255114chr11118914899118916205+
ENSG00000271751chr11118935974118936388-
ENSG00000272186chr11118938085118938409-
ENSG00000245385chr11119206959119208019-
ENSG00000245248chr11119252488119397374+
ENSG00000263873chr11119288661119289824+
ENSG00000255216chr11119879313119882867-
ENSG00000246790chr11121318040121323722-
ENSG00000255248chr11121899063121987031-
ENSG00000255090chr11122026130122293579-
ENSG00000255045chr11124614530124616233-
ENSG00000250073chr11124629025124635832+
ENSG00000245498chr11124670346124704383+
ENSG00000255027chr11125773142125808811-
ENSG00000264299chr11125827795125828547+
ENSG00000254694chr11126078506126078922-
ENSG00000254905chr11126162817126164149-
ENSG00000254703chr11128561575128565918-
ENSG00000233220chr11129872833129874251+
ENSG00000175773chr11130184888130263688+
ENSG00000255455chr11130736149130740142-
ENSG00000204241chr11133902167133916744+
ENSG00000254648chr11133905727133907002-
ENSG00000255545chr11134306367134375555+
ENSG00000251226chr11134605490134633704+
ENSG00000256948chr12215690221016-
ENSG00000249695chr12246577258335-
ENSG00000256694chr12273830275487-
ENSG00000256540chr12276022291565-
ENSG00000256577chr12312808314189+
ENSG00000261799chr12383120386289-
ENSG00000177406chr12740057772872+
ENSG00000250132chr1210832991100356-
ENSG00000267285chr1214949991496153+
ENSG00000249628chr1216096911616484-
ENSG00000235049chr1220383682045740-
ENSG00000256271chr1227776662781386-
ENSG00000246627chr1227851672800366-
ENSG00000258325chr1229060432922068-
ENSG00000258092chr1229063022913104-
ENSG00000250899chr1231506033154116+
ENSG00000256164chr1243579314385350-
ENSG00000256115chr1253431635352317-
ENSG00000256417chr1253996465492819+
ENSG00000256146chr1254251275428513+
ENSG00000256218chr1254752145476940-
ENSG00000255983chr1254977555515817+
ENSG00000256433chr1265030716504235+
ENSG00000215039chr1265481676560733-
ENSG00000239002chr1266193886619717+
ENSG00000255966chr1266414566642664-
ENSG00000269968chr1266469606647536-
ENSG00000247853chr1266877886693905+
ENSG00000219410chr1267724266781235+
ENSG00000269892chr1268521516852807+
ENSG00000272173chr1270526717053767-
ENSG00000272062chr1270724087085165+
ENSG00000257084chr1270724097073610+
ENSG00000271969chr1270741127074545+
ENSG00000126749chr1270800567085781+
ENSG00000255896chr1270800847105520+
ENSG00000272201chr1270876837089103+
ENSG00000205885chr1272606487275097+
ENSG00000256967chr1272816757283794-
ENSG00000226711chr1283328058368747+
ENSG00000215241chr1283880118395160+
ENSG00000226091chr1284485828549399-
ENSG00000249790chr1289408538948385+
ENSG00000214851chr1292081829217666-
ENSG00000245105chr1292177739220651+
ENSG00000237248chr1293925999395635+
ENSG00000260423chr1295200609550213+
ENSG00000256442chr1297996109800605-
ENSG00000257027chr1298111639814681+
ENSG00000245648chr121051636810551105+
ENSG00000256039chr121070596210710648+
ENSG00000247157chr121170096411743303+
ENSG00000255670chr121263828712644515+
ENSG00000247498chr121308066013137579+
ENSG00000256084chr121436952414374231+
ENSG00000256751chr121472068414772689+
ENSG00000261324chr121491543814920865-
ENSG00000255727chr121515476715159617+
ENSG00000256564chr121672034516726874+
ENSG00000255864chr122436619024715524-
ENSG00000246695chr122609226226112698-
ENSG00000256894chr122627808826279550-
ENSG00000256234chr122636409726488789-
ENSG00000255750chr122638375226472653-
ENSG00000247903chr122712451927132515+
ENSG00000248100chr122769998327705706-
ENSG00000256377chr122784932127863703-
ENSG00000247934chr122831623128343299-
ENSG00000257176chr122943335129470781-
ENSG00000246331chr123090800830933673+
ENSG00000235884chr123094797730955645+
ENSG00000226472chr123114997331158938-
ENSG00000245614chr123117369731226781-
ENSG00000256232chr123151641531522235-
ENSG00000255867chr123174285731768600+
ENSG00000255760chr123203001332040137-
ENSG00000259937chr123355781033558831-
ENSG00000255652chr123434397234371788-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.