The Cancer LncRNome Atlas



Glioblastoma Multiforme (GBM)

TCLA currently contains information about lncRNA expression, copy number alterations (focal alterations and high-frequent alterations), promoter methylation and cancer-associated SNPs for each cancer type.

Please select the data type that you are interested in:

 

Detectable lncRNAs in GBM

To ensure detection reliability and reduce background noise, we applied two filters in each cancer type: the first eliminates any gene whose 50th percentile RPKM value is equal to or less than 0; the second filter selects only genes whose 90th percentile RPKM value is greater than 0.1.

 
first page | previous page | next page | last page     
Ensembl IDChromosomeStartEndStrand
ENSG00000261618chr87974976479752757+
ENSG00000272138chr88068037780715077+
ENSG00000249328chr88068160780783994-
ENSG00000272518chr88086870080869616-
ENSG00000272264chr88094495980945535-
ENSG00000251867chr88139679681397854-
ENSG00000254162chr88144724181451370-
ENSG00000260317chr88145353581455339+
ENSG00000253214chr88206651482076834+
ENSG00000272425chr88218763482189805-
ENSG00000254027chr88219210682193681-
ENSG00000253374chr88243385382445510+
ENSG00000254689chr88279761282835428+
ENSG00000260493chr88608431286089297-
ENSG00000254208chr88608975786090385-
ENSG00000253549chr88635408086377144-
ENSG00000253154chr88685193486963312+
ENSG00000254231chr88734550387355543-
ENSG00000253500chr88855421488767946-
ENSG00000253171chr88898639389031341+
ENSG00000253553chr88933906589749363+
ENSG00000271156chr88982054789821137-
ENSG00000251136chr89062163890769955-
ENSG00000246792chr89165866991668826+
ENSG00000254251chr89181870291871468-
ENSG00000253738chr89207213792082417-
ENSG00000246662chr89422553194712661-
ENSG00000271971chr89472760694728341-
ENSG00000253854chr89473180294733395+
ENSG00000253722chr89474544494746250+
ENSG00000264448chr89492796294928910-
ENSG00000253704chr89556595095581973+
ENSG00000272509chr89589683795897298+
ENSG00000253878chr89596226595963624+
ENSG00000253773chr89621668496822364+
ENSG00000254224chr89724765597250262+
ENSG00000245970chr89905395499056349+
ENSG00000272321chr89944889799451518+
ENSG00000271930chr89995582399956326+
ENSG00000253948chr8100008991100025272-
ENSG00000253824chr8101393488101426687-
ENSG00000260368chr8101925475101926616-
ENSG00000253395chr8102134373102138386-
ENSG00000261087chr8102179033102181857-
ENSG00000271882chr8102220376102220786+
ENSG00000246263chr8103251622103265561+
ENSG00000272037chr8103268620103270049+
ENSG00000253669chr8103817745103822199+
ENSG00000254281chr8103991013104012412+
ENSG00000247081chr8104169218104311000-
ENSG00000266289chr8104395306104396082-
ENSG00000254041chr8106155088106200834-
ENSG00000251003chr8106792474107072752-
ENSG00000254615chr8107282372107285127+
ENSG00000253327chr8117886663117889107+
ENSG00000254343chr8121064419121068440+
ENSG00000272502chr8121824459121825599+
ENSG00000248690chr8122651533122656933+
ENSG00000272384chr8123792210123793069-
ENSG00000272043chr8123792999123793310+
ENSG00000253607chr8124014800124042991+
ENSG00000271975chr8125318430125320617-
ENSG00000245149chr8125474726125486817-
ENSG00000253106chr8125500751125503884+
ENSG00000272486chr8125591872125592889+
ENSG00000255080chr8125847126125869758-
ENSG00000249816chr8125860979125966570+
ENSG00000253167chr8126052926126057231+
ENSG00000245164chr8126934552126963493-
ENSG00000254286chr8127570120127725660+
ENSG00000246228chr8128302062128494384-
ENSG00000249859chr8128806779129113499+
ENSG00000250400chr8130228713130253496-
ENSG00000229140chr8130363937130692485-
ENSG00000254317chr8130844547130856750+
ENSG00000253507chr8132320792132329879+
ENSG00000270132chr8134241299134241940+
ENSG00000261220chr8134585426134586104+
ENSG00000272456chr8135735190135736192+
ENSG00000259820chr8135804263135810515-
ENSG00000253988chr8139075511139085483+
ENSG00000254258chr8140472305140475259-
ENSG00000259891chr8141515912141518142-
ENSG00000259758chr8141530255141539600-
ENSG00000253210chr8142136143142140060-
ENSG00000261655chr8142363503142365465-
ENSG00000271959chr8142444645142448054+
ENSG00000261710chr8143171188143172980+
ENSG00000261693chr8143485013143488389+
ENSG00000261044chr8143701734143702425+
ENSG00000234616chr8143738874143763386-
ENSG00000253741chr8143783670143808391-
ENSG00000253196chr8143844534143847845+
ENSG00000247317chr8144063155144099854-
ENSG00000253716chr8144362331144363860-
ENSG00000272172chr8144372569144372791-
ENSG00000254389chr8144448801144450718-
ENSG00000254338chr8144499849144501320+
ENSG00000254859chr8144624143144631899-
ENSG00000254741chr8144661806144662840+
ENSG00000271912chr8144683416144685394+
ENSG00000254812chr8144714241144715926-
ENSG00000181097chr8144778324144780583+
ENSG00000203499chr8144816310144828507+
ENSG00000204791chr8145104030145106423+
ENSG00000255224chr8145132905145134168-
ENSG00000254690chr8145538253145538801-
ENSG00000272115chr8145634876145635360+
ENSG00000232600chr8145660602145665354+
ENSG00000255182chr8145721001145730827-
ENSG00000261139chr8145721763145725663-
ENSG00000265393chr8145737950145739056+
ENSG00000254533chr8145923999145924570-
ENSG00000263612chr8145939284145940230+
ENSG00000255559chr8146228197146231432+
ENSG00000227518chr92765730891+
ENSG00000225655chr97270188826+
ENSG00000231808chr9112716113754-
ENSG00000227155chr9454304492112-
ENSG00000226403chr9547317549531+
ENSG00000236199chr920419002046023-
ENSG00000236404chr924227022641395-
ENSG00000232104chr935267233671646+
ENSG00000235326chr936745463691814+
ENSG00000225408chr957190215720244-
ENSG00000236924chr966459566670635+
ENSG00000225489chr967165486727438+
ENSG00000225706chr988581308862255+
ENSG00000234740chr91327450913279186-
ENSG00000270547chr91340637913433052-
ENSG00000226197chr91344649013487510+
ENSG00000225472chr91431708414357907+
ENSG00000234779chr91672681216727522+
ENSG00000260912chr91945320719455171+
ENSG00000227071chr92068330320684687-
ENSG00000171889chr92145564121559668-
ENSG00000265194chr92185890921861925-
ENSG00000240498chr92199477722121096+
ENSG00000234840chr92264619922824212+
ENSG00000234676chr92695577826956293-
ENSG00000235453chr93255114232567003+
ENSG00000231193chr93284059632841760-
ENSG00000233554chr93316697333179981+
ENSG00000260947chr93369745733700984+
ENSG00000233776chr93373297333738414-
ENSG00000235481chr93378594833818793-
ENSG00000237159chr93456801334582827+
ENSG00000261215chr93466190034666026-
ENSG00000230074chr93466566234681295+
ENSG00000269900chr93565774835658015-
ENSG00000227388chr93577216035790429+
ENSG00000235387chr93590948035911683+
ENSG00000260100chr93707881037079773-
ENSG00000233137chr93707989337090398+
ENSG00000234160chr93750914737510296+
ENSG00000204860chr93862047138624987+
ENSG00000204837chr94196161542019580-
ENSG00000223839chr94246631742474239+
ENSG00000233244chr94302774843032877-
ENSG00000237357chr94440176644404440+
ENSG00000235659chr94500190745003117-
ENSG00000223379chr94500487945023236+
ENSG00000231527chr94510839245112532+
ENSG00000232116chr94548457245488153+
ENSG00000225353chr94627084146274928-
ENSG00000231212chr94666124246662837-
ENSG00000204802chr94668542946688137-
ENSG00000226007chr94684363846846025+
ENSG00000238113chr96645728566469310+
ENSG00000234665chr96651348866553911-
ENSG00000170161chr96655327366555928+
ENSG00000182021chr96701740067032072-
ENSG00000231242chr96908253669108793-
ENSG00000237543chr96914693969149621+
ENSG00000240907chr96917421369179458-
ENSG00000234394chr97092144470945542+
ENSG00000224958chr97097010570972768-
ENSG00000233178chr97101060971021416-
ENSG00000234506chr97115845771161505-
ENSG00000243888chr97204316472043637-
ENSG00000261447chr97228766572288629+
ENSG00000204706chr97270073272790804-
ENSG00000268364chr97280891372873782-
ENSG00000225434chr97492034674958126+
ENSG00000224825chr97710046777114043-
ENSG00000229587chr97762474477630952-
ENSG00000233926chr98430462884391815+
ENSG00000229109chr98583424685849157+
ENSG00000254473chr98632250986328293+
ENSG00000226877chr98644457186452776+
ENSG00000235298chr98658714886590692+
ENSG00000230303chr98840063788408395-
ENSG00000226237chr98956361489616948+
ENSG00000231632chr99162494991625393-
ENSG00000224945chr99170351991724849-
ENSG00000237372chr99231656692334585+
ENSG00000231107chr99306318493195787-
ENSG00000230537chr99386723993869586-
ENSG00000229694chr99388134493945044+
ENSG00000237422chr99388142093925369-
ENSG00000235641chr99392205193927858+
ENSG00000233081chr99418852094189426+
ENSG00000225511chr99490358094922396+
ENSG00000227603chr99619761496199403-
ENSG00000269946chr99692857196962909+
ENSG00000269929chr99693874096940174+
ENSG00000230262chr99693888496966850-
ENSG00000232063chr99709475897123230+
ENSG00000236095chr99766271197667036+
ENSG00000271384chr99816927298169944-
ENSG00000237857chr99817711698189078-
ENSG00000271155chr99826851798269918+
ENSG00000271659chr99827632798276802+
ENSG00000175611chr99852151398638259-
ENSG00000225194chr99878201498790247-
ENSG00000232283chr99900874499012675+
ENSG00000224848chr99944933899483403+
ENSG00000242375chr99995763399959969-
ENSG00000203279chr999962757100000982-
ENSG00000254876chr9100000731100059596+
ENSG00000255036chr9100000779100139569+
ENSG00000267026chr9101609511101634697-
ENSG00000271086chr9102117619102139522-
ENSG00000255145chr9102648608102668883-
ENSG00000254571chr9102677359102692178-
ENSG00000270332chr9106842305106855354-
ENSG00000226334chr9107689834107691173+
ENSG00000230013chr9107753077107754062-
ENSG00000260230chr9111892573111898218-
ENSG00000259953chr9114794835114800010-
ENSG00000226609chr9115511182115512736-
ENSG00000271631chr9115647438115648047+
ENSG00000228623chr9115759495115774507-
ENSG00000225684chr9115865618115873780-
ENSG00000231528chr9115875353115882208+
ENSG00000226604chr9119048108119051048-
ENSG00000244757chr9119050897119080968-
ENSG00000228512chr9120545726120630349+
ENSG00000226752chr9123587106123616651+
ENSG00000239593chr9124042141124045008-
ENSG00000235865chr9124043046124047808-
ENSG00000261534chr9124577953124581731-
ENSG00000237548chr9124646915124725998-
ENSG00000269979chr9125086887125087594+
ENSG00000270102chr9125093146125093622+
ENSG00000269970chr9125134884125135104+
ENSG00000261094chr9125699902125702612+
ENSG00000236901chr9125871773125877756-
ENSG00000236668chr9126768556126771675-
ENSG00000234921chr9126793903126794803-
ENSG00000235204chr9127021529127023435-
ENSG00000224020chr9127420746127460910+
ENSG00000271341chr9127704887127705774-
ENSG00000271833chr9130129049130129676+
ENSG00000225032chr9130578345130584799+
ENSG00000257524chr9130630143130649066-
ENSG00000227218chr9130696782130703231+
ENSG00000269988chr9130870860130871604-
ENSG00000234771chr9130873450130881013-
ENSG00000225951chr9131231236131235291-
ENSG00000228395chr9131291180131314689-
ENSG00000234705chr9131425413131425857-
ENSG00000223478chr9131486724131495473+
ENSG00000267834chr9131766781131767277-
ENSG00000268707chr9131932713131933219+
ENSG00000204055chr9131939050131972827+
ENSG00000224307chr9132044737132048007+
ENSG00000233901chr9132094579132121817+
ENSG00000204054chr9132245730132275947+
ENSG00000239353chr9132264269132275965+
ENSG00000234789chr9132402755132403561+
ENSG00000270755chr9132806992132807360+
ENSG00000230289chr9134391945134397616-
ENSG00000224992chr9135644840135645599-
ENSG00000225756chr9136519708136522435-
ENSG00000235106chr9136890561136899788+
ENSG00000225361chr9138354573138372623-
ENSG00000226706chr9138395119138398293-
ENSG00000238058chr9138799658138805359+
ENSG00000260193chr9138999654139001270-
ENSG00000227512chr9139437333139438287+
ENSG00000237886chr9139440664139444345+
ENSG00000228401chr9139543062139554873-
ENSG00000233016chr9139615818139622636-
ENSG00000228544chr9139698379139703300-
ENSG00000260190chr9139831621139832440-
ENSG00000235117chr9139931492139932407+
ENSG00000261793chr9140063306140066436-
ENSG00000260996chr9140188320140190173-
ENSG00000233013chr9141106637141143444+
ENSG00000226179chrX281725282586+
ENSG00000236871chrX15153201518295+
ENSG00000236017chrX15206621532921+
ENSG00000223511chrX18514771874878+
ENSG00000223571chrX22523362254451-
ENSG00000248421chrX24050232407012-
ENSG00000234449chrX37710513800358-
ENSG00000205663chrX38094793838787-
ENSG00000236120chrX55714625644346-
ENSG00000234129chrX1098801111129234-
ENSG00000235385chrX1328416713321571-
ENSG00000233535chrX1397351213982023+
ENSG00000237836chrX1890841418912615+
ENSG00000242500chrX1993126719934282-
ENSG00000224204chrX2218085022191100-
ENSG00000233785chrX2379110923801073-
ENSG00000260822chrX2456363324568583+
ENSG00000241886chrX3071632430740049+
ENSG00000243055chrX3071811530742291-
ENSG00000226679chrX3808064438082920+
ENSG00000238123chrX3866082138663136-
ENSG00000223486chrX3986852939871435+
ENSG00000234636chrX4059465240597950+
ENSG00000270155chrX4109510941095832+
ENSG00000223714chrX4113499241136031+
ENSG00000236276chrX4380897843828866+
ENSG00000270069chrX4560463945629677-
ENSG00000230844chrX4640492846407671+
ENSG00000267064chrX4751823247519776+
ENSG00000224292chrX4836491148367226-
ENSG00000228343chrX4843816248439545-
ENSG00000270012chrX4912951749132231+
ENSG00000234390chrX4964189249643844-
ENSG00000229151chrX5109979651139314-
ENSG00000226530chrX5113936351208513+
ENSG00000232593chrX5312332753196196+
ENSG00000270189chrX5319827953200096+
ENSG00000227486chrX5593455656041606+
ENSG00000230105chrX5664482456650891+
ENSG00000204272chrX5675569256844813+
ENSG00000226310chrX5714809557153676+
ENSG00000235437chrX6272982262780929-
ENSG00000231669chrX6480826164820630+
ENSG00000260118chrX6723331267234743-
ENSG00000203588chrX6938369269385056-
ENSG00000228427chrX7040340970418025-
ENSG00000269911chrX7199743271998921+
ENSG00000229807chrX7304048673072588-
ENSG00000225470chrX7316415973290243+
ENSG00000228906chrX7316880873169393+
ENSG00000230590chrX7318379073513409-
ENSG00000270223chrX7322922473231303-
ENSG00000271430chrX7342006473461983-
ENSG00000271533chrX7342981173433495-
ENSG00000250534chrX7800322878010503+
ENSG00000272066chrX8276103182764222-
ENSG00000272294chrX8276630482767135+
ENSG00000259640chrX8375503383757461-
ENSG00000261295chrX9992832799928978+
ENSG00000228609chrX100258821100262962-
ENSG00000228275chrX100877973100879154-
ENSG00000261101chrX100882858100883508+
ENSG00000271147chrX101854440101969599+
ENSG00000223546chrX102024089102140334+
ENSG00000239407chrX102139342102161086+
ENSG00000234405chrX102752451102755245+
ENSG00000231154chrX102942212102946700+
ENSG00000231728chrX103172005103174131-
ENSG00000237863chrX107979770107982133+
ENSG00000260802chrX110754890110765627+
ENSG00000204025chrX111125125111147218+
ENSG00000271826chrX114752490114797058-
ENSG00000203650chrX117973519117991849+
ENSG00000237903chrX118556880118557510+
ENSG00000224281chrX118599997118603061-
ENSG00000227285chrX119055224119056803-
ENSG00000258545chrX119170201119280760+
ENSG00000244439chrX119745184119754929+
ENSG00000229033chrX122867024122868144+
ENSG00000232412chrX123093083123095191-
ENSG00000235189chrX129003040129091504-
ENSG00000213468chrX130836678130964671-
ENSG00000232160chrX131351175131566890+
ENSG00000223749chrX133677367133680741-
ENSG00000227060chrX133684003133693953+
ENSG00000196972chrX134229058134232664-
ENSG00000178947chrX134555868134561999+
ENSG00000225235chrX134654008134654599-
ENSG00000233093chrX135721702135724588+
ENSG00000232611chrX135923090135929956-
ENSG00000234062chrX135991554136103789+
ENSG00000241489chrX148564621148614672-
ENSG00000238039chrX148593039148607803-
ENSG00000241769chrX148614831148622358-
ENSG00000224871chrX149097880149098916+
ENSG00000235703chrX149106846149392815+
ENSG00000270052chrX150666198150666826+
ENSG00000197463chrX151876743151883038-
ENSG00000184324chrX151922445151928738+
ENSG00000243768chrX152617487152625568+
ENSG00000259886chrX152689210152691934+
ENSG00000260081chrX152864795152869808+
ENSG00000228616chrX152876149152878380+
ENSG00000232725chrX153001080153031933-
ENSG00000235802chrX153234776153235538+
ENSG00000231830chrX153562310153563387-
ENSG00000261773chrX153746164153746955-
ENSG00000224216chrX154564167154581271-
ENSG00000224533chrX154695631154841277+
ENSG00000225393chrX154697947154716707+
ENSG00000270726chrX155233883155255299+
ENSG00000233070chrY28348852870667-
ENSG00000231535chrY28709532970313+
ENSG00000233864chrY1477426514804162+
ENSG00000248395chrY2093459420990548-
ENSG00000176728chrY2103438721239302-
ENSG00000260197chrY2185382721856492-


 
first page | previous page | next page | last page     
Contact us | | Terms & Conditions.
Copyright © 2015 University of Pennsylvania. All Rights Reserved.